• 中国人民解放军空军军医大学第二附属医院普通外科(西安 710038);
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目的 从转录组学层面研究肝内胆管癌(ICC)发生异常的生物学通路并发现与 ICC 预后相关的基因。方法 通过 t 检验和倍数变化法筛选差异表达基因并对相关基因进行 KEGG 功能富集分析;利用 STRING 数据库构建蛋白质互作网络,通过计算每个节点的度、介数和接近中心性来寻找网络的 Hub 节点;采用 log-rank 检验进行 Kaplan-Meier 生存分析,识别 ICC 预后相关基因。结果 在 3 个数据集中重复的 ICC 相关的差异表达基因共 1 134 个,主要参与 15 条通路,包括参与 DNA 复制、细胞周期、药物代谢、RNA 转运、PPAR 等信号通路和氨基酸合成等生物学过程。通过蛋白质互作网络分析发现 TAF1、HNF4A、E2F4、GRB2、MYC 和 TP53 基因是 Hub 节点。因 GRB2 和 TP53 既是蛋白质互作网络的 Hub 节点也是 ICC 死亡相关的基因,因此分析其高低表达发现,GRB2 基因低表达者较其高表达者总生存期更长(P=0.040 9),而 TP53 是低表达者较其高表达者总生存期更短(P=0.027 3),且在 TCGA 数据库中也得到验证。结论 ICC 的发生与细胞代谢异常息息相关,且 TAF1、HNF4A、E2F4、GRB2、MYC 和 TP53 这些差异表达基因是 ICC 发生发展的重要基因,尤其是 GRB2 和 TP53 基因的表达与 ICC 预后有关。