• 1. 山东中医药大学中医学院(济南 250014);
  • 2. 山东中医药大学附属医院周围血管病科(济南 250014);
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目的 通过生物信息学方法挖掘下肢静脉性溃疡(VLU)的差异表达基因,并进一步探究疾病的分子机制、预测早期诊断标志物以及治疗靶点。方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载 VLU 表达谱芯片,使用 R 语言分析 VLU 与正常皮肤愈合的炎性期的差异表达基因(DEGs),对其进行基因本体分析和通路富集分析,并获得通路关键基因;使用 STRING 数据库和 Cytoscape 3.2.1 软件进行蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络分析,获得核心基因。结果 共获得 DEGs 共 409 个,其中表达上调 173 个、表达下调 236 个。GO 分析结果显示,表达上调的 DEGs 主要分布于含胶原的细胞外基质、角质化包膜和胶原三聚体中,涉及皮肤发育、角质形成细胞分化、角质化等生物学过程,介导细胞外基质结构成分、赋予抗张强度的细胞外基质结构成分、整联蛋白结合等分子功能;表达下调的 DEGs 主要涉及分布于三级颗粒、分泌性颗粒膜及三级颗粒膜中,涉及对趋化因子的反应、白细胞迁移、中性粒细胞趋化等生物学过程,介导趋化因子受体结合、趋化因子活性、细胞因子活性等分子功能。KEGG 通路富集分析结果显示,表达上调的 DEGs 主要富集于细胞外基质(ECM)-受体相互作用和蛋白质消化吸收通路,COL1A1、COL1A2 及 COL6A6 为通路关键基因;表达下调的 DEGs 主要富集于金黄色葡萄球菌感染、Toll 样受体信号通路、白细胞跨内皮迁移等通路,IL-1B、CXCL8、IL-10、MMP1 及 MMP9 为通路关键基因。PPI 网络核心基因为 FPR1、FPR2、IL1B、IL10 及 CXCL8。结论 COL1A1、COL1A2、COL6A6、IL-1B、CXCL8、IL-10、MMP1 和 MMP9 及其参与的信号通路影响 VLU 愈合,核心基因 FPR1、FPR2、IL-1B、IL-10 和 CXCL8 可作为潜在治疗靶点。