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目的 通过加权基因共表达网络分析(weighted gene coexpression network analysis,WGCNA)方法找到与乳腺癌骨转移相关的关键基因,为寻找新的靶向治疗药物提供理论支持。方法 从基因表达综合数据库下载 GSE2034 数据集中共 286 例乳腺癌患者的基本临床特征及肿瘤标本基因表达的信息。通过 R 软件实现基因芯片的分析。采用 R 软件中植入的 WGCNA 包用于加权相关网络分析中的各种统计分析。采用 SPSS 软件进行单因素 Cox 比例风险回归分析。结果 通过 WGCNA 方法选取了方差变异度最大的前 5 000 个基因做进一步的基因富集分析,最终共构建了 15 个基因共表达模块,其中 magenta 模块与乳腺癌骨转移呈正相关关系(r=0.94,P<0.001)。进一步分析发现,magenta 模块中与乳腺癌骨转移高度相关的 6 个关键基因为:Ral GTPase 激活蛋白亚单位 α-1(RALGAPA1)、B 细胞抗原受体复合物相关蛋白 α 链(CD79A)、人免疫球蛋白 kappa 链(IGKC)、抑制蛋白 β2(ARRB2)、FDCP 6 同源异构体(DEF6)和人免疫球蛋白 lambda 链(IGLV2)。结论 RALGAPA1、CD79A、IGKC、ARRB2、DEF6 和 IGLV2 可能在乳腺癌骨转移中起到重要作用。

引用本文: 贺功建, 杜正贵. 乳腺癌骨转移相关的基因研究. 中国普外基础与临床杂志, 2020, 27(10): 1254-1258. doi: 10.7507/1007-9424.201912069 复制

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